九江市中医院南院建设工程占地80亩，一期建筑面积近8万平方米，开设床位675张，加上北院开设床位345张，两院共计可开设床位1020张，其中南院以肾病科、骨伤科、外科系列等住院科室为主，实际开设床位550张，预留发展床位115张，其中肾病科开设病区5个，开设床位250张，外科和骨科分别设三个病区共计300张，能够基本满足新技术、新业务开展需要。由于南院受周边地理位置和交通影响，医院在南院门急诊开设立足实事求是，不求急求全，开设有专家门诊和内外妇儿等一级科室。北院保留糖尿病科、肝病科、肿瘤科、中风病科、肺病科、老年病科等内科系列和门诊诊室，功能检查仪器设备均备配齐全，如CT、CR、生化分析仪、彩超等。在对北院医疗用房升级改造完成后，能满足九江市临床病人、工伤病人、残疾病人、老年病人、亚健康病人和政治政策病人康复医学临床的需要，满足城镇社保、新农合、商保、私人购买康复医学临床服务的需要。北院内科病区由现有的两个扩大到四个，实际开放床位180张，极大缓解内科系列床位紧张的局面，特别是肝病科和肿瘤科。医院今年已为肿瘤科配备了肿瘤热疗系统和陀螺刀项目，目前肿瘤热疗系统已投入使用，陀螺刀项目也正在开展前期准备工作，预计在今年8月份即可投入使用，届时肿瘤治疗真正做到中医特色突出，西医手段多样的格局，促进医院多层次、深领域发展。南、北两院各自功能完善，设备齐全，有1.5T核磁共振（MRI）、128层螺旋CT、DR机、大C型臂、肛肠治疗仪、麻醉机、多功能数字化X线机、荧光定量PCR检测系统、多功能心电监护仪、德国进口的腹腔镜、胸腔镜、前列腺汽化电刀镜、膀胱镜特定蛋白分析仪、全身彩超4台、脑电图、全自动生化分析仪、血液透析机60台、雅培AXSYM化学荧光免疫分析仪、全市首台流式细胞仪等先进的医疗设备。"一院两区"并肩发展格局的形成，将进一步完善医院的服务功能布局和科室结构调整，是医院迈入现代化、科学化、规范化管理的起点，也为医院实现赶超和跨越式腾飞奠定了坚实的基础。