医院始建于1945年10月，2012年12月成为上海交通大学附属第六人民医院南院。 2012年12月通过上海市医院综合评价（评审）中心的三级医院评审。

2012年10月整体迁入南桥新城中心南奉公路6600号，占地面积182亩，建筑面积9.6万平方米，核定床位1000张，实际开放床位1041张；2012年门急诊总人次为124.43万，出院人次为4.23万，手术人次为1.53万，平均住院日为8.48天。现有职工1476人，其中硕博士研究生147人（博士29人），研究生导师34人（博士生导师3人），高级职称163人（正高级38人）。拥有1.5T核磁共振、64排和16排螺旋CT、DSA、ECT、高压氧舱、重症监护系统、层流手术室等先进的医疗设备和设施。

设临床医技科室28个，其中市医学重点专科4个（妇产科、创伤骨科、微创中心及糖尿病专科）；市六院全托管科室4个（骨科、内分泌代谢科、放射科及超声医学科）；区重点专科7个（骨科、普外科、心血管内科、危重医学科、妇产科、内分泌代谢科及眼科）；区特色专科5个（消化内科（内镜）、介入放射科（血管介入）、泌尿外科（腔镜技术）、微创外科（普外科和妇科腔镜技术）及神经外科（脑血管疾病）。

先后成为上海交通大学医学院教学医院、同济大学和苏州大学教学医院，南方医科大学、安徽理工大学（非直属）附属医院，安徽理工大学临床医学院，是南昌大学等10余所医学院校的教学基地，上海市住院医师规范化培训基地、上海市护理学会急诊急救护士实训基地；拥有市级中心实验室和国家药物临床试验基地；建成硕博士点20个，已招收研究生38人，毕业6人；获国家自然科学基金项目1项，省部级科研项目8项，市局级科研项目29项，区级科研项目46项；国家、市级继续教育项目33项；发表SCI论文40篇；获市医学科技三等奖3项；获国家实用新型专利32项。

医院坚持“以病人为中心”的服务宗旨，内强素质，外树形象，综合实力和服务能力快速提升，2011、2012年保持上海市卫生系统万人问卷调查全市同级同类医院第一名，先后荣获上海市文明单位、上海市卫生系统文明单位、全国无烟医院、上海市健康单位、上海市慈善义工先进集体、上海市禁毒先进集体等称号。医院将以升级迁建为新起点，进一步加强内涵建设，努力为广大群众提供更加温馨、便捷、优质的医疗服务，为区域经济社会发展作出积极贡献。