瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所三级甲等大型综合性教学医院。医院占地面积12万平方米，建筑面积24.5万平方米，绿化面积4万平方米，核定床位1600张，全院职工3445人，其中医师1010余人（其中正副教授及各类高级科技人员593人）。拥有中国科学院院士陈竺、中国工程院院士王振义、陈赛娟等一大批在国内外享有较高知名度的医学专家。医院设有34个临床科室、9个医技科室；现有国家教育部重点学科3个（内分泌、血液、消化），上海市重中之重学科1个（血液），上海市重点学科1个（内分泌），上海市优势学科一个（肾脏），上海市教委重点学科6个（消化外科、血液科、内分泌科、骨科、烧伤科、心脏内科），上海市卫生局医学领先专业重点学科3个（消化外科、血液科、肾脏内科）。医院还有6个市级研究所（上海市伤骨科研究所、上海市高血压研究所、上海市内分泌研究所 、上海烧伤研究所、上海血液学研究所、上海消化外科研究所），2个校级研究所（上海交通大学医学院神经病学研究所、上海交通大学心血管病研究所），1个院级研究所（感染病与呼吸病研究所），8个校级研究室，3个院级实验室。此外，还建立了国家重点实验室和教育部重点实验室各1个（医学基因组学重点实验室），2个卫生部重点实验室（人类基因组重点实验室、内分泌代谢重点实验室），4个上海市重点实验室（人类基因组研究重点实验室、血管生物学重点实验室、中西医防治骨关节病损重点实验室、内分泌肿瘤重点实验室）。并通过整合上述科研力量，建立了附属瑞金医院生物医学研究院。同时，还建有与临床诊疗密切结合的一些中心，包括分子医学中心、糖尿病研究中心、血栓与止血研究中心、血液病诊治中心、基因诊断中心、眼科中心、青少年生长发育中心、介入治疗中心、生殖医学中心等。另外上海市卫生局有4个质量控制中心（康复、骨科、心脏介入、血液）挂靠在瑞金医院。