发病前会有 4～6 天的潜伏期，期间会有外阴的灼热感。
潜伏期后最早出现的症状为外阴部成簇的丘疹，继之形成 1～2 mm 的水疱，数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，最后结痂自愈，整个病程约 2 周左右。可伴有全身不适，如低热、头痛、淋巴结肿大等。
男性同性恋人群发生生殖器疱疹时，可伴有肛门直肠部位的感染，表现为肛门直肠疼痛、便秘、分泌物增加、里急后重感，肛周可有疱疹性溃疡。
引起生殖器疱疹的主要原因是感染了单纯疱疹病毒。
生殖器疱疹的传染源为生殖器疱疹患者，以及部分有疱疹史但无症状的病毒携带者。主要是依赖性接触传播的，传染性极强，与患者发生性接触后 70% 可能会感染生殖器疱疹。
怀疑生殖器疱疹最直接的诊断方法就是检测到单纯疱疹病毒，一般需要进行病毒培养、病毒抗原的检测、细胞学检测等。
如果没有检测到病毒，还可以通过血清学检测（抽血检查血中有无单纯疱疹病毒的抗体）来进一步诊断，并且通过检测到不同类型的抗体，可以推测是近期感染，还是既往感染。
治疗的关键是及时、足量地使用抗病毒药物，可以减轻症状、控制疱疹的传染和复发。
生殖器疱疹复发率很高，很容易复发。因为生殖器疱疹的治疗效果虽然很好，但很难彻底杀灭体内病毒。
复发症状常较首次发病时轻，治疗方法相同。如果复发频繁，需要长期服药，这叫做「抑制疗法」。
患者治疗的同时，对性伴侣也要进行检查或治疗，可以降低一部分复发风险。
可能会造成女性不孕、流产等。
预防生殖器疱疹有以下几种措施：
避免不洁性接触，特别是注意不要与生殖器疱疹患者发生性关系；正确使用安全套可减少病毒的传播。
注意保持私处清洁和干燥，防止感染。
感冒、受凉、劳累等因素，均可引起机体抵抗力下降，导致生殖器性疱疹复发。
生殖器疱疹患者的内衣、床单等用品，要进行严格的消毒。
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