有些患者听说，核苷类药物有直接抗病毒作用，疗效快；干扰素主要是免疫调节，作用持久，因此不禁想，如果联合治疗，岂不是取长补短？事实上，医学家们也有相似的判断，并且在不断的探索后得到了肯定的答案。
两类抗乙肝病毒药的机制可互补：
慢乙肝治疗的关键是抗病毒治疗，抗病毒药目前有两机制完全不同的药物：干扰素和核苷类药物。核苷类药直接抑制病毒，能较快的降低血清病毒学水平，从而缓和病情；但这类药物无提升免疫的作用，停药后易复发。干扰素是免疫调节剂，可以激发机体免疫对抗病毒，甚至清除肝内cccDNA，不过激发免疫有个体差异，不是每位患者都能有疗效，但在治疗有效的患者身上，疗效持久稳定，防止肝硬化、肝癌的长期结果肯定。
联合治疗的疗效具有前景：
越来越多的研究发现联合治疗的确可以提高疗效。基于这些证据，2015年亚太肝病学会指南肯定了联合治疗的疗效，明确指出联合治疗“具有前景”。
两种联合治疗方案目前备受关注较：一种是同时应用，另外一种是在核苷经治的患者中应用。一项国际、多中心的研究证实，和核苷和长效干扰素单独治疗相比，长效干扰素同时联合核苷类治疗能更多的降低表面抗原的水平，使更多患者获得表面抗原清除，这意味着患者接受联合治疗实现表面抗原清除，临床治愈的机会更大。
在核苷经治患者中的联合治疗也有令人鼓舞的结果，OSST研究NEW SWITCH研究等多项研究都提示，正在接受核苷类治疗的患者，加用长效干扰素治疗能够提高e抗原转换率和表面抗原清除率，这意味着正在接受核苷类治疗的患者有望缩短疗程，摆脱终生治疗的困扰。
总之，联合治疗能使两类不同机制的抗病毒药协同作用，发挥更好的疗效。不过哪些患者更适合接受联合治疗，联合治疗后如何停药等，还需根据每位患者的具体情况，具体判断，也需要更多研究的探索。
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